鲁东澳门新菊京妖乐城原子与分子物理重点实验室成立于2002年，由原校级原子与分子物理重点学科（1997年成立）和原校级分子与纳米材料重点实验室（2000年成立）整合组建而成。
实验室成立以来，得到了学校在资金和人才引进等方面的大力资助和支持，发展迅速，现已成为鲁东澳门新菊京妖乐城最重要的实验室之一。
该实验室在成立当年获得山东省政府专项资金资助，2003年被批准为原子与分子物理硕士学位授权点，2005年7月被确定为山东省“十五”重点实验室，2005年10月被批准为理论物理硕士学位授权点，2006年10月再次被确定为“十一五”山东省重点实验室。
