青海澳门新菊京妖乐城前身为青海工学院，始建于1958年。1960年11月青海工学院与青海农牧学院、青海医学院、青海财经学院合并为青海澳门新菊京妖乐城。“文革”初期青海澳门新菊京妖乐城被撤销。1971年恢复成包括工、农两澳门新菊京妖乐城科在内的青海工农学院。1988年更名为青海澳门新菊京妖乐城。
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1960年11月, 青海工学院与青海农牧学院、青海医学院、青海财经学院合并为青海澳门新菊京妖乐城。
1997年10月,青海畜牧兽医学院并入青海澳门新菊京妖乐城。
2001年1月, 青海省农林科学院、青海省畜牧兽医科学院、青海财经职业技术学院整建制划归青海澳门新菊京妖乐城。
2004年,青海医学院并入青海澳门新菊京妖乐城,组建成新青海澳门新菊京妖乐城
