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 1987年经总部批准，学院开始招收攻读硕士学位研究生，1990年经国务院学位委员会审核，批准学院为全军首批军事学硕士学位授予单位，现拥有10个硕士学位授权点，4个博士学位授权点。涉及工学、理学、军事学三澳门新菊京妖乐城()科门类，形成了指挥与技术、工程与管理相结合的学科专业体系。

1999年经军队学位委员会批准，授权我院在“作战指挥学”学科开展在职人员以同等学力申请硕士学位工作。目前，学院已成为全军培养潜艇作战指挥等专业高层次人才的培养基地。